卷一中风总括中风死候类中风总括伤风总括痉病总括痉病死证破伤风痹病总括周痹痹病生死证痹入脏腑证痿病总括痿痹辨似痿病治法香港脚总括香港脚死证卷二内伤总括内伤外感辨似虚劳总括虚劳死证虚劳治法痨瘵总括痨瘵治法
自叙卷上脾胃伤风中寒暑热暑厥中伏暑注夏湿燥火症风湿风温湿温瘾疹痛风劳倦痰火咳嗽喘青筋气怒中恶伤食卷下伤酒黄胆积聚瘕僻痞块癫狂痫症三消霍乱疟疾痢疾泄泻疝气香港脚痿症
卷一 新着脉法心要部位胃脉浮脉沉脉数脉迟脉长脉短脉大脉小脉洪脉微脉实脉虚脉紧脉缓脉芤脉濡脉弦脉弱脉滑脉涩脉动脉伏脉促脉结脉革脉牢脉疾脉细脉代脉散脉奇经八脉冲阳等脉五脏死脉对待比类纲目以脉主病脉真从脉症
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
序序例第一案~第九案第十案~第十九案第二十案~第二十九案第三十案~第三十九案第四十案~第四十九案后记
灵枢经
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
伤寒辨要笺记
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻