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叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
第一章 总则第二章 药品生产企业管理第三章 药品经营企业管理第四章 医疗机构的药剂管理第五章 药品管理第六章 药品包装的管理第七章 药品价格和广告的管理第八章 药品监督第九章 法律责任第十章 附则
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
奇方类编序卷上头面门清空膏都良丸头疼奇方又治头疼偏头疼方治年老人气血虚头疼方治头上白秃治秃头川芎茶调散薄荷八两半夏白术天麻汤治抓破面上皮治两腮红肿治腮治下颏落方治久患头疼年久不愈者太阳疼头昏头痛须发门
简介序卷一卷二卷三卷四
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记