简介序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十
简介序略言存济堂药局修合施送方并加药法
序叙卷之一·元集总论辨眼症虚实论辨眼疼有虚实论辨药宜忌论辨热症有虚实气不同论辨五轮病源用药论辨五轮生克论辨心火克肺金白珠生赤丝论辨肺金克肝木黑睛生翳膜论辨眼内生云翳用凉药难退论辨眼珠生翳膜滋肾更甚论辨
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
序凡例卷一·慎疾法语省身修德卫生总要饮食宜忌养生铭保命箴寡欲说延年六字诀惜三宝益五脏先时加谨摄生要言勿药须知十二段动功行功六字静功解十二时病为善去疾吕祖治百病符卷二·杂症头疾面疾眼疾耳疾鼻病口病唇病舌
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
析骨分经
外因类中风中暑中湿中寒疟痉〔附〕破伤风历节香港脚内因类虚劳骨蒸水饮痰涎水气胀满积聚寒疝〔附〕病奔豚气黄瘅〔附〕黄胖消渴〔附〕强中痼冷积热恶寒发热汗证诸气病诸血病诸血病吐血唾血咳血（挟痰）血衄鼻大衄、九