叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
前言总论第一章 炮制的起源和发展第二章 炮制的意义和目的第三章 炮制的作用一、炮制对药物性味功能的影响二、炮制对药物成分的影响三、加热和用水四、常用辅料五、炮制的工具第四章 炮制过程中的注意事项第五章
简介医方集宜内容细目叙凡例八款六气十二经见证卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
房中补益
简介序第一章·伤寒要义第二章·六经方药第三章·表里寒热第四章·气血虚实第五章·伤寒诊法第六章·伤寒脉舌第七章·伤寒本证第八章·伤寒兼证第九章·伤寒夹证第十章·伤寒坏证第十一章·伤寒复证第十二章·调理诸
咽喉秘集
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
简介自序集之一·初生门集之二·肝脏部集之三·心脏部一集之四·心脏部二集之五·心脏部三集之六·心脏部四集之七·脾脏部（上）集之八·脾脏部（下）卷之九·肺脏部·肾脏部